Ұлыбританияда жарғанаттарда бұрын белгісіз болған сарбековирус анықталды

Ұлыбританияда жарғанаттарда бұрын белгісіз болған сарбековирус анықталды
Ұлыбританияда жарғанаттарда бұрын белгісіз болған сарбековирус анықталды
Anonim

Ғалымдар RhGB01 сарбековирусының жаңа түрін табылған жылқылардың 53 фекальды үлгілерін зерттей отырып, SARS-CoV және SARS-CoV-2 сияқты коронавирустың географиялық және түрлік диапазонын кеңейткеннен кейін тапты. Болжам бойынша, олар Австралия мен Жапониядан Еуропа мен Африкаға дейінгі ринолофидалардың барлық ауқымында кездеседі.

Бір жылдан астам уақыттан кейін, мыңдаған зерттеулерге, ДДҰ есептеріне, тергеулерге және тағы басқаларға қарамастан, қазіргі коронавирустық індеттің көзі әлі белгісіз. Жылқы таяқшалары (ринолофус) SARS-CoV (2002 жылы пайда болған ауыр респираторлық ауыр синдром) мен біздің SARS-CoV-2 үшін табиғи қожайын болып саналады, бірақ адамға вирусты жұқтырған аралық тасымалдаушы анықталмаған.

Жарқанаттардың ассортименті Ескі әлемнің көп бөлігін қамтиды, бірақ сынамалардың негізгі бөлігі бұрын Шығыс және Оңтүстік-Шығыс Азияда алынған: онда жарғанаттардың он түрінен SARS-пен байланысты 50-ге жуық коронавирус табылған, олардың 48-і тоғыз түрлі жылқылар Роман сарбековирустарының филогенетикалық талдауы, яғни SARS-пен байланысты коронавирустар-Қытайдағы жылқының пішіні олардың SARS-CoV және SARS-CoV-2-мен дәл байланысты екенін көрсетті.

Шығыс Англия университетінің ғалымдары бұл деректерді толықтыруға шешім қабылдады. Кеше Scientific Reports журналында жарияланған зерттеудің авторлары Сомерсет, Монмутшир және Уэльсте 2020 жылдың тамызы мен қыркүйегінде ондаған ұсақ жылқылар тәрізді жануарлардың нәжісін жинады. Жануарларды қарақұйрықтардың жанында және ормандарда ұсталған торлар немесе торлар арқылы қолға түсірді.

Нәжіс РНҚ тұрақтандыруға арналған РНҚ -лятор ерітіндісі бар жеке стерильді түтіктерге салынады, салқындатылады және талдау алдында мұздатылған күйде сақталады. Содан кейін ғалымдар 53 үлгінің бірінде бұрын белгісіз болған вирусты анықтайтын геномдық секвенирование жасады. Ол RhGB01 деп аталды. Вирус құрамында 10 кодтау гені бар, ал SARS-CoV және SARS-CoV-2-11 кодтау гендері ORF8 ақуызын қосқанда.

«Ақуыз мен нуклеотидтер тізбегінің филогенезі RhGB01 2008 жылы Болгарияда табылған Blasius жылқының сарбековирусы (Rhinolophus blasii) BM48-31 / BGR / 2008 монофилетикалық кладта біріктірілгенін көрсетті. RhGB01 адамның SARS-CoV және SARS-CoV-2 патогенді бета-коронавирусын қамтитын қабаттардан ерекшеленеді, бірақ ауыр респираторлық синдроммен байланысты коронавируспен тығыз байланысты »,-деп жазады ғалымдар.

SARS-CoV және SARS-CoV-2-нің ағзаға енуінің негізгі рецепторы ACE2 ферменті болып қала береді, оған бұл мүмкіндікті рецепторлармен байланысатын доменнің (RBD) рецепторларды байланыстырушы мотиві береді. S -ақуыз - ол вирустың қабығын құрайды. Жаңа RhGB01 сәйкесінше RBD SARS-CoV және SARS-CoV-2-мен 68% және 67% аминқышқылдарының идентификациясын бөліседі, бірақ RBM-де оларға ұқсас 43% және 48% ғана. Салыстыру үшін: SARS-CoV-2, жарғанаттар мен панголиндермен байланысты ең жақын вирустардың 89% және 86% RBD SARS-CoV-2 мен 75, 77% SARS-CoV сәйкес келеді. Сонымен қатар, RhGB01 Таяу Шығыс респираторлық синдромы вирусына (MERS) RBM ұқсастығын шамалы көрсетеді. Алайда, SARS-CoV-2-ге тән S1 және S2 ақуыздарының түйісуінде фуриннің қосымша бөліну орны жоқ.

«SARS-CoV және SARS-CoV-2 рецепторларымен байланысатын доменмен салыстырғанда ұқсастықтың төмен деңгейі, байланыс қалдықтарының болмауы және құрылымдық айырмашылықтар ACE2-мен байланысу қабілетінің жоқтығын көрсетеді. Сондықтан, RhGB01 мутацияланбаса зоонозды болуы екіталай. Бірақ адам жасушаларында ACE2 немесе басқа рецепторлармен байланыстың жоқтығын эксперименталды түрде растау және сүтқоректілердің ACE2 рецепторларымен байланысу қабілетін анықтау үшін in vitro талдаулар қажет », - деп атап өтті зерттеу авторлары.

RhGB01 мыңдаған жылдар бойы бар болып көрінгенімен, ғалымдар жылқының жарғанаттарындағы коронавирустарға, сондай -ақ басқа жарқанаттарға бақылауды күшейткен жөн деп санайды. Ақыр соңында, SARS-CoV да, SARS-CoV-2 де, шамасы, мутация, гомологиялық рекомбинация (екі ұқсас немесе ұқсас хромосомалар арасындағы нуклеотидтер тізбегінің алмасуы) және кем дегенде бір аралық хост арқылы «өту» нәтижесінде дамыды.

Яғни, табиғи хосттың вирустық предшественнигі генетикалық бейімделуді алды, бұл адамдарға табысты жұқтыруға және біздің арамызда берілуге мүмкіндік берді. Ал сарбековирустарды коинфекция арқылы гомологиялық рекомбинациялау мүмкіндігі бар жерде жаңа зооноздардың пайда болу қаупі бар.

«SARS тәрізді вирусы бар кез келген жарқанат мутацияның қазанына айналуы мүмкін. Егер RhGB01 бар жарғанаттар SARS-CoV-2 жұқтырса, онда бұл вирустар будандастырылады-және жаңа вирус пайда болады, ол адамдарға жұқтыруы мүмкін »,-деп қорытындылады зерттеушілер.

Ұсынылған: